Een groot voordeel van bio-energie is dat het zowel een duurzame als hernieuwbare bron van energie
is. Dat wil in het kort zeggen dat het milieuvriendelijk en onuitputtelijk is. Men maakt handig gebruik
van een natuurlijke, steeds terugkerende cyclus van vastlegging en vrijlating van CO2, de zonne-energie die ligt opgeslagen in biomassa.
Hieruit volgt dat bio-energie kan bijdragen aan vermindering van de uitstoot van CO2, en dus de
vermindering van het broeikaseffect. Ook is het een vorm van energie die op den duur fossiele energie
zou kunnen vervangen. Het is immers algemeen bekend dat de olie die op deze planeet aanwezig is op
begint te raken.
Er zijn nog meer argumenten op te noemen voor het gebruik van bio-energie. Zo kan afval, wat toch
aanwezig is, en soms zelfs voor problemen zorgt, nog nuttig worden gebruikt. Ook is het gebruik van
bio-energie relatief simpel te combineren met in de huidige energievoorziening. Dit komt doordat biomassa
als vaste of vloeibare brandstof kan worden opgeslagen. Ook kunnen sommige bestaande
technologieën en installaties, bestemd voor fossiele brandstoffen, op biomassa worden toegepast.
Bio-energie heeft wel te kampen met een nadeel dat voor veel vormen van duurzame energie lijkt te
gelden: het is duur. Althans, in vergelijking met de kosten voor benutting van fossiele brandstoffen.
Installaties die biomassa verwerken zijn duur, en liggen vaak op afgelegen plaatsen. Dit zorgt ervoor
dat er lange buizen heen moeten lopen die bepaald prijzig zijn. Ondanks dat sommige bestaande
installaties voor dit doeleinde kunnen worden aangewend zullen er toch nieuwe moeten komen in het
geval van een uitgebreidere toepassing.
Wel is het zo dat de bewerking van bio-energie relatief goedkoop is ten opzichte van de benutting van
andere vormen van duurzame energie.
Verder geldt als nadeel voor het gebruik van bio-ethanol en biodiesel dat de motoren van voertuigen
zullen worden moeten aangepast indien van deze biobrandstoffen gebruikgemaakt zal worden.
